Acontece que há uma explicação bem detalhada de como isso funciona para o NLS (National Language Support), isso no Microsoft Developer Network (MSDN). A essência segue:
...The purpose... defining NLS services (sorting, time/date formatting, and keyboards/IMEs) for locales that do not yet have native support in Windows to avoid conflict. - Locale IDs Assigned by Microsoft
Basicamente, isso significa que os desenvolvedores podem usar as IDs de localidade caso o Windows do usuário não não tem o idioma do usuário e outras informações de localidade já. Dessa forma, o desenvolvedor pode oferecer seu próprio suporte de idioma para esse usuário, independentemente de a Microsoft ter localizado o Windows para esse local.
Parece que eu perdi isso no MSDN, de alguma forma. De qualquer forma, se alguém se deparar com isso no Google, o acima deve explicá-lo.
Se eu entendi errado, por favor, comente ou ofereça outra resposta!