Existem vários algoritmos aleatórios diferentes com Fisher-Yates sendo um dos mais popular. Mesmo se um jogador usar esse algoritmo, sua implementação dependerá de vários outros fatores (linguagem de codificação, suporte a números aleatórios). A menos que um jogador copie diretamente o código de outro programa, ele será diferente na implementação.
Além disso, enquanto a maioria dos jogadores 'shuffle' uma lista de reprodução eu vi aqueles que sempre escolhem aleatoriamente a próxima música para tocar (resultando na mesma música tocada duas vezes seguidas).
É estranho que você afirme que jogadores diferentes 'embaralham' a mesma playlist na mesma ordem. Mesmo usando o mesmo algoritmo (ou mesmo jogador) deve resultar em uma lista de reprodução aleatória cada vez que é embaralhada.