Estou usando o Ubuntu com criptografia de disco completo há mais de um ano. O CD de instalação alternativo para o Ubuntu 12.04 torna mais fácil. Durante a instalação, quando você perguntar como deseja particionar seus discos, uma das opções dirá algo como "Guiado - configure o LVM com criptografia". Basta selecionar esse e ele fará todo o trabalho avançado para você. Tudo o que você precisa fazer é criar uma senha e pronto.