A solução é reinstalar o Skype.
A versão do Skype que acompanha o 11.04 não funcionará em 11.10, e você precisará removê-lo e instalá-lo novamente (a partir do centro de software). Depois disso, o Skype funcionará e o indicador também.
Eu atualizei de 11.04 para 11.10, instalei o sni-qt e ainda não tenho nenhum indicador do Skype. O que eu faço?
A solução é reinstalar o Skype.
A versão do Skype que acompanha o 11.04 não funcionará em 11.10, e você precisará removê-lo e instalá-lo novamente (a partir do centro de software). Depois disso, o Skype funcionará e o indicador também.