Definitivamente, obtenha MKV2VOB que é o melhor conversor que usei para arquivos MKV para playstation 3. Converte-os em menos de 5 minutos, literalmente! E funcionará exatamente com a mesma qualidade que você conseguiu.
Use a opção de alta taxa de bits x264 para máxima qualidade, ele também carrega a mesma fonte de áudio, então ele conterá o áudio dolby digital / dts e manterá a mesma resolução.