Todas as distros do Linux são iguais e todas são diferentes. Com isto dito, se você entende um bem real, você pode se locomover em qualquer um deles bem o suficiente e você pode procurar o resto facilmente. O que uma empresa usa não será baseado nos aplicativos que eles executam, ou apenas no fato de que eles executam aplicativos da web. Na maior parte, eles serão executados por qualquer um que estivesse encarregado de configurar as coisas no momento. Algumas empresas escolhem distros que oferecem opções de suporte (como o chapéu vermelho) e outras não se importam. Realmente não há uma boa resposta à sua pergunta, pois ela é muito subjetiva - todos terão uma resposta baseada em sua experiência, não necessariamente baseada em todas as empresas existentes e em todas as distribuições disponíveis em uso.