A maneira de provar que um certificado de chave pública é seu é ter a chave privada que a acompanha. Um arquivo .cer é apenas o certificado de chave pública, portanto, ele não será exibido como seu certificado pessoal, a menos que você encontre a chave privada correspondente a ela e instale-a também.
O comando certreq
provavelmente criou o par de chaves público-privadas, armazenou a chave privada em algum lugar no Armazenamento de Certificados do Windows e empacotou apenas a chave pública como parte de uma solicitação de assinatura de certificado (CSR) para enviar à Apple. A Apple provavelmente assinou seu CSR para gerar seu certificado de chave pública (.cer), mas era esperado que você soubesse onde estava sua chave privada e certificasse-se de ter sua chave privada no armazenamento local de certificados do usuário.