rmdir não suporta curingas. Apenas aceita nomes completos de arquivos.
Você pode tentar esta alternativa:
for /d %f in ("C:\Program Files\FogBugz\Plugins\cache\[email protected]_*") do rmdir /s/q "%~f"
(Os argumentos /s/q para rmdir fazem a mesma coisa que rm -rf no Unix. O argumento for /d torna for nomes de diretórios correspondentes em vez de nomes de arquivos.)
Lembre-se que o shell cmd.exe não faz expansão de curingas (diferente de Unix sh ) - isso é tratado pelo próprio comando.