O módulo nvidia
do kernel está carregado?
lsmod | grep nvidia
Se não, carregue com
sudo modprobe nvidia
Se isso ajudar, talvez você queira carregá-lo automaticamente no momento da inicialização, anexando nvidia (em uma nova linha) a /etc/modules
Eu acho que a fonte do seu problema é a instalação manual. Se você tivesse instalado a partir de repositórios, o instalador o configuraria para você.
Nota: Eu não sou um usuário da nvidia, a pesquisa rápida do google sugere que o módulo é chamado nvidia, mas pode ser chamado de outra forma. Apenas digite modprobe n
e pressione TAB, seu shell deve completar automaticamente o nome para você.