FINALMENTE, Eu encontrei isso na documentação oficial,
A instalação do Runfile pergunta onde você deseja instalar o Toolkit e as Samples durante uma instalação interativa. Se estiver instalando usando uma instalação não interativa, você pode usar o - parâmetros toolkitpath e --samplespath para alterar o local da instalação:
./runfile.run --silent \
--toolkit --toolkitpath=/my/new/toolkit \
--samples --samplespath=/my/new/samples
Os pacotes RPM não suportam locais de instalação personalizados através dos gerenciadores de pacotes (Yum e Zypper), mas é possível instalar os pacotes RPM em locais personalizados usando o parâmetro --relocate do rpm:
$ rpm --install --relocate /usr/local/cuda-6.5=/my/new/toolkit rpmpackage.rpm
Os pacotes Deb não suportam locais de instalação personalizados através do gerenciador de pacotes (apt), mas é possível instalar os pacotes Deb em locais customizados usando o dpkg - parâmetro instdir
$ dpkg --instdir=/my/new/toolkit --install debpackage.deb
Para pacotes RPM e Deb, você precisará instalar os pacotes na ordem correta de dependência; normalmente os gerenciadores de pacotes cuidam disso automaticamente. Por exemplo, se o pacote "foo" tiver uma dependência no pacote "bar", você deve instalar pacote "bar" primeiro e pacote "foo" segundo. Você pode verificar as dependências de um pacote RPM ou Deb como segue
$ rpm -qRp rpmpackage.rpm
$ dpkg -I debpackage.deb | grep Depends