Acho que você está usando o TotalCommander de 32 bits em um Windows de 64 bits.
Eu não tenho nenhum problema em encontrar o SnippingTool com o meu TC (64 bits) no meu Windows 10 de 64 bits.
O software de 32 bits (incluindo o TC, se você usar a versão de 32 bits) não obtém acesso à pasta real system32. Ele será redirecionado para syswow64 em vez disso.
Isso não é específico do Windows 10. O Windows de 64 bits foi projetado para funcionar dessa maneira. Acontece também no Vista 64-bti, WIn7 e Win8.