Use o software de migração de dados da Samsung para clonar (e redimensione) a unidade.
A ativação do Windows permanecerá ativa, pois você está atualizando apenas uma peça de hardware. Mesmo que isso não aconteça (eu nunca vi isso), você pode apenas ligar para o MS e explicar, e eles lhe darão o código de ativação.
Eu realizei esse processo em cerca de 15 computadores no último ano (laptops e desktops) e tive poucos problemas (nenhum relacionado à ativação). Se algo der errado, você ainda terá a unidade original como backup.
Você pode obter a chave do Windows usando o Nirsoft Key Finder de qualquer forma, embora eu pense.