De acordo com as especificações PCI-Express, as placas PCI-Express podem ser conectadas a slots com mais pistas do que o necessário sem problemas físicos, os cartões e slots são projetados dessa maneira. (Em algumas placas-mãe, você também pode conectar cartões em slots com menos faixas, mas nem sempre é o caso.)
Se o seu cartão não é uma placa gráfica, você pode ter problemas; alguns suportam apenas placas gráficas (chamadas placas PEG, para PCI Express Graphics), especialmente placas mais antigas.
Veja Uma placa PCI Express regular funcionará em um slot" PCI Express x16 Graphics (PEG) "? para obter mais informações.