Pode ser que um firewall (seu, seu roteador, seu ISP ...) esteja bloqueando todas as conexões de IRC. (O servidor mostrado está online no momento.)
Tente conectar usando as portas alternativas (não padrão) - 6665, 6666, 8000, 8001 ou 8002. A sintaxe Hexchat é irc.freenode.net/6665
na janela de configuração do servidor ou /server irc.freenode.net 6665
na linha de comando.
Melhor ainda, tente uma conexão criptografada por SSL - a porta padrão é 6697, e a freenode também aceita conexões em 7000 & 7070. A sintaxe é a mesma, mas com +port
; por exemplo. irc.freenode.net/+6697
(como na entrada mais acima da sua lista atual de servidores) ou /server irc.freenode.net +6697
.