Fn não é uma tecla normal do teclado, como os modificadores Ctrl, Shift e AltGr. Para uma tecla modificadora padrão, o microcontrolador dentro do teclado envia um scancode para o próprio modificador, que é então interpretado pelo sistema operacional e combinado com outras teclas simultâneas. A tecla Fn é uma forma de chave meta-modificadora, pois faz com que o sistema operacional veja os scancodes alterados quando outras teclas do teclado são pressionadas. Isso permite que o teclado emule diretamente um teclado de tamanho normal, para que o sistema operacional possa usar mapas de teclado padrão projetados para um teclado de tamanho normal. No entanto, como o sistema operacional não tem noção da tecla Fn, a chave normalmente não pode ser remapeada no software, ao contrário de todas as outras teclas padrão do teclado.
Embora seja mais comum que o processamento da chave Fn ocorra diretamente no microcontrolador do teclado, não oferecendo nenhum conhecimento ao computador principal se a tecla Fn foi pressionada, pelo menos um fabricante, a Lenovo, realiza esse mapeamento no BIOS correndo no CPU principal. Isso permite remapear a tecla Fn modificando o manipulador de interrupção da BIOS.
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Responda à pergunta: Remapeamento não é possível via sistema operacional, mas somente via BIOS (em alguns casos).