Você pode usar o AutoHotkey para interceptar cada comando do Win + xxx e reatribuir um pressionamento de tecla diferente a ele. Por exemplo, você poderia reconhecer o Win + Esquerda como Ctrl + Win + Esquerda, que você atribuiria à tarefa que você queria que o Win + Left original realizasse.
As interceptações e atribuições de chave básica são bem simples. Por exemplo, eu uso muito o OneNote, mas não gosto de algumas das teclas que ele usa. Para abrir uma nota rápida (que eu não uso) é Win + N, mas para abrir o OneNote em si (o que eu uso) é Win + Shift + N. O script para reatribuir Win + N para atuar como Win + Shift + N é tão simples assim: #n::Send #N