A maneira apropriada para um editor de texto atualizar (salvar) um arquivo é criar um novo arquivo no mesmo diretório com um nome temporário, escrever novos conteúdos nele e depois apagar o arquivo antigo e renomear o novo para o seu nome real .
Justificativa: Se você estiver reescrevendo um arquivo, qualquer falha catastrófica (perda de energia, setor defeituoso no disco, etc.) pode deixar esse arquivo corrompido ou apenas parcialmente gravado. Portanto, qualquer editor sane não faz gravações no local. Estou muito surpreso que o NetBeans fez isso em versões mais antigas.Naturalmente, esse método de exclusão / renomeação não está ciente de seu link físico, e procurar um disco inteiro por outros links para um arquivo não é uma opção, portanto nenhum editor faz isso.
Eu não acho que você pode ter um comportamento antigo, e mesmo se você puder, esta é uma idéia muito ruim. Se você não puder alternar para links (que não são afetados por esse problema), eu suponho que você terá que procurar outra maneira de fazer o que está fazendo.