A criação de um metapacote significa que todos os pacotes dos quais ele depende devem estar instalados, sem chance de customização de recursos devido à presença ou ausência de vários pacotes. Isso pode ser corrigido removendo o metapacote antes de remover outros pacotes, mas os usuários nem sempre têm certeza se o metapacote pode ou não ser removido com segurança.
Um grupo yum permite que todos os pacotes sejam instalados de uma só vez, mas também permite escolher e escolher sem frustrar o usuário final. Isso pode causar problemas se um usuário instalar apenas pacotes específicos manualmente sem instalar o suficiente para que o aplicativo seja funcional, mas interdependências precisas entre os vários pacotes de aplicativos devem garantir que um conjunto mínimo seja instalado quando qualquer um deles for escolhido.