Isenção de responsabilidade: Eu não posso garantir que isso funcione para você também, para mim.
Eu fiz restaurações semelhantes (no Windows, embora) simplesmente copiando os arquivos (todo o diretório /usr/local/mysql
... não deveria estar sob /var/mysql
de qualquer maneira?). Claro que você precisará parar o daemon do MySQL e reiniciar se depois de terminar.
Além disso, verifique as permissões do arquivo, apenas para o caso de algo ter mudado.