Você está tentando usar a opção "link" (obsoleta !!) do docker, isso não é um problema em si, mas você deve respeitar a sintaxe
--link <name or id>:alias
então, você tem que substituir o seu
--link php:9000
com o correto
--link php
você não precisa de um alias porque nomeou o container fpm da mesma forma que você o referiu no default.conf. A outra coisa importante é montar a pasta de arquivos php no contêiner fpm, mas você já fez isso direito.