Sim, você pode fazer isso. Basta mover os arquivos de sessão indesejados do diretório /usr/share/xsessions para outro diretório.
A maneira mais rápida de fazer isso é digitando gksu nautilus no prompt do traço (pressionando Alt - F2 ) e pressionando Enter. Ele irá abrir nautilus com poder de root. Vá para a pasta /usr/share/xsessions e remova ou mova o arquivo apropriado em outro diretório.
Você pode abrir esses arquivos para determinar qual arquivo realmente precisa ser movido. Use o gedit para abri-los. Por exemplo, você pode querer remover os arquivos "Gnome / Openbox" ou "KDE / Openbox" para outro diretório.