Como lbaile200 diz que você deve tentar instalar o gerenciador de configurações do CompizConfig e desabilitar os efeitos da janela.
Mas acredito que isso possa ter algo a ver com o cache do sistema. Você pode tentar limpá-lo com o recurso Ubuntu Tweak's
'Janitor'. Instale o Ubuntu ajustar com estes comandos:
sudo add-apt-repository ppa:tualatrix/ppa
sudo apt-get update
sudo apt-get install ubuntu-tweak
Em seguida, abra-o a partir do painel ou com o comando do terminal:
ubuntu-tweak
Ele será exibido assim e você precisará selecionar Start Janitor
(como visto abaixo):
(Eu estou usando o tema do ícone numix circle e por isso pode parecer diferente para você de acordo com o seu tema)
Agora, no zelador, selecione o tipo de cache que você deseja remover e, em seguida, selecione Clean
. Isso deve remover o cache indesejado do seu computador. Agora veja se o seu problema persiste.
Você também pode tentar redefinir a unidade para seus padrões. Consulte esta resposta.
PS: - Para aqueles de vocês que estão se perguntando por que a limpeza do cache resolveria problemas gráficos, consulte aqui . O OP lá diz seu cache de compensação que resolveu seu problema.