Para suspensão imediata, para garantir que você não esteja pausando algo que desestabilize seu sistema, PsSuspend da Microsoft SysInternals.
Para evitar que coisas normalmente automáticas sejam executadas, clique em Iniciar | Executar | msconfig. Um artigo sobre o gerenciamento de programas de inicialização está no HowToGeek .
Você também pode editar a ACL (permissões) do EXE de destino e impedir que seu usuário sem privilégios o execute. Isso pode ser mais seguro do que renomeá-lo, porque você pode fazer o login como administrador e ainda acessar o arquivo como pretendido. Pode ser uma permissão especial (de permissões avançadas em vez de nível superior) e essa resposta pode ajudar.