Eu estava tendo um problema semelhante. A velocidade da ventoinha variava o tempo todo com a menor alteração no uso da CPU, tornando impossível acostumar o som dela.
Minha solução para todos os problemas de velocidade do ventilador 1 é instalar o SpeedFan . Existem também algumas poucas alternativas para o linux, se este for o seu sistema operacional.
1 Além da limpeza regular