O comando gsettings para ajustar o modo de ocultação do lançador seria:
gsettings set com.canonical.Unity2d.Launcher hide-mode 2
Observe que este comando funcionará apenas para Unity-2D e não para Unity-3D.
Os parâmetros suportados para este comando e o que eles fazem:
0: Never hide; The launcher is always visible.
1: Auto hide; The launcher will disappear if it not actively used.
2: Intellihide; The launcher will disappear only if there is an active window over it.