Eu não acho que você pode com descompactar.
Você pode fazer o seguinte:
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Arquivos zip dentro do zipfolder desde o início (sem a pasta em si) e, em seguida, você pode usar o descompactar da maneira desejada:
cd <path>/zipfolder; zip ZipFile.zip *
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Faça alguns ajustes depois de descompactar:
mv ~/path/to/my/destination/zipfolder/* ~/path/to/my/destination/
rm -f ~/path/to/my/destination/zipfolder