Você pode excluir de forma recursiva os diretórios nos quais coloca seus dados (como Documents , Videos , Images , Downloads , etc.) e os outros em seu diretório pessoal (por exemplo, .cache , .gnome , .ssh ), sua raiz, suas subpastas, etc., não devem ser removidos desta maneira!
Uma maneira útil e bastante segura de fazer isso é usar o comando rmdir (com find ):
find . -empty -type d -exec rmdir {} +
Começa no diretório de trabalho atual.