Eu inicio yum
de dentro do chroot, ele só vai olhar em myroot/etc/yum.repos.d
. Se você iniciá-lo do sistema normal, ele sempre procurará em /etc/yum.repos.d
.
Portanto, inicie yum
de dentro do chroot. É claro que primeiro você terá que instalar o yum
e todo o necessário para isso no chroot.