Bem, certamente há potencial para o seu computador receber pacotes WOL e permanecer em 24/7. Se o consumo de energia do seu computador é a sua principal preocupação, então sim, isso pode ser um problema para você.
Caso contrário, todos os outros princípios de segurança se aplicam, como verificação de vírus, firewall, somente abrindo portas que você usou e garantindo que essas portas sejam bloqueadas com senhas strongs com quaisquer serviços aos quais o computador esteja se expondo.
Se o seu roteador permitir a comunicação remota no lado da WAN com algum tipo de shell, provavelmente você poderá fazer com que o roteador sinalize o WOL, permitindo que você feche a porta completamente para fora (estou pensando em algo como SSH )
Outra coisa a considerar é se você poderia configurar um servidor de rota ou de retransmissão de pacotes do seu subdomínio (não tenho certeza do tipo de acesso que você tem lá), para que você possa configurar o roteador na lista branca de uma máquina específica. encaminhamento de porta designado para realizar o WOL.
Espero que isso ajude.