O VLC tem uma lista de reprodução e o pode reproduzir vídeos em flash . Pode ser o caso de o suporte para determinados formatos não estar incluído no pacote binário fornecido com o Ubuntu. Você pode procurar por um pacote Ubuntu que tenha suporte para ffmpeg (libformat) e win32codecs ou você pode construir o VLC a partir da fonte e inclua suporte para os codecs que você deseja (etapa 4).