como eu sei, o linux substitui o gerenciador de inicialização do Windows pelo seu próprio (principalmente o Grub), mas isso não causa problemas (provavelmente porque o gerenciador de inicialização do Windows não suporta o Linux). Se você instalar o Linux após o Windows, você terá apenas o menu de inicialização do Linux para inicializar o Linux ou o Windows e iniciar o Win funcionará como antes.
Antes de instalar o linux eu recomendaria criar partições adicionais para ele. Eu acho que precisa de 3:
sistema um home - não tem que ser um separado, mas eu prefiro ter arquivos de sistema em outra partição, em seguida, pasta de início swap - cerca de 2xRAM quantidade de tamanho - é usado para dados temporários