Não sei como é o seu código ou se a pasta de trabalho 1 possui alguma formatação condicional que não está sendo copiada adequadamente; mas aqui está uma das maneiras que você pode "copiar" o formato de uma célula em uma pasta de trabalho para uma célula em outra pasta de trabalho (supondo que ambas as pastas de trabalho estejam abertas):
Workbooks("SOURCE.xls").Sheets("SHEETNAME").Range("A1").Interior.Color = _
Workbooks("DESTINATION.xls").Sheets("SHEETNAME").Range("A1").Interior.Color
Para cores de fonte:
Workbooks("SOURCE.xls").Sheets("SHEETNAME").Range("A1").Font.Color = _
Workbooks("DESTINATION.xls").Sheets("SHEETNAME").Range("A1").Font.Color
Substitua os nomes dos arquivos, os nomes das planilhas e os valores do intervalo para que correspondam aos seus arquivos.