Se as janelas em execução, colocando este texto em um arquivo .bat, devem fazer o seguinte:
cd "C:\Program Files\Oracle\VirtualBox
VBoxManage snapshot "Virtual Name" take "Snapshot Name"
VBoxManage startvm "Virtual Name"
Se você está executando um * NIX, você terá que mudar isso para algo como
VBoxManage snapshot "Virtual Name" take "Snapshot Name"
VBoxManage startvm "Virtual Name"
Como você não precisará alterar seu diretório para acessar o comando VBoxManage e salvá-lo em um arquivo .sh, altere o atributo para executável e invoque-o para executá-lo.