Geralmente você cria um script ( como este ) que primeiro limpa todas regras e, em seguida, cria as regras.
Esses comandos de salvamento foram adicionados posteriormente. Eu pessoalmente não gosto deles: você não pode roteirizar.
Normalmente, você adiciona o script ao diretório /etc/init.d. O script no exemplo já é um script de inicialização. Então você tem que adicionar links para /etc/rcX.d. Se você tiver uma distro baseada no Debian, o comando update-rc.d fará isso por você. Caso contrário, leia esta , é a descrição mais independente de distro que encontrei.
Ou pesquise sobre o rc.d e os níveis de execução.