Você pode criar um link físico em vez do alias, ele solucionará o problema do ícone. Se você está ok com o Terminal: basta executar ln path/to/your/file.pdf ~/Desktop
isso irá criar hardlink para o seu pdf na área de trabalho, se não: eu não consigo encontrar nenhum outro gui para tal coisa, mas eu posso compartilhar meu pequeno aplicativo (droplet executando o Applescript, preciso reescrevê-lo algum dia :))