Isso realmente depende das suas necessidades, mas na sua situação, eu acho que é melhor deixar o SMP ativado para o convidado. Eu baseio isso no fato de que, quando você está na VM, provavelmente está tentando realizar algo específico e não se importa com o desempenho do host ou com outras VMs que possam estar em execução.
No entanto, é provável que, na computação típica de desktop, você não esteja fazendo algo que realmente mostre benefícios visíveis de configurações de vários CPUs. E em uma VM, o maior gargalo para o desempenho é provavelmente a E / S. Realmente é um ato de equilíbrio entre todas as demandas simultâneas em seu hardware: CPU, RAM, E / S, etc.