Possível causa:
No FTP, não há formato padrão para listagens de diretórios; tudo é enviado como texto legível e os clientes FTP da GUI devem tentar detectar o formato de saída.
Tente ativar a função de log do seu cliente FTP ou use a linha de comando ftp
para ver o que é realmente recebido do servidor. Talvez o servidor nem use permissões? Talvez ele use algum formato de lista de diretório estranho?