Eu tenho isso desde anos, e parece acontecer quando estou 'muito rápido' com uma sequência de atividades (mas apenas no Windows 10).
Pressione ESC e tente CTRL + C novamente, então deve funcionar.
Se isso não ajudar, você pode ter outro aplicativo em execução em segundo plano, que se sente autorizado a mexer com a área de transferência. Desative qualquer outra coisa até que o autor seja identificado.