Existe uma maneira de impedir que o Explorer desmarque arquivos alterados?
Até onde eu sei, isso não é possível com o Explorer.
Você pode tentar um gerenciador de arquivos alternativo.
xyplorer não desmarca os arquivos modificados. Eu tenho usado isso como substituto do Explorer por alguns anos.
XYplorer is a tabbed file manager for Windows. It features a powerful file search, a versatile preview, a highly customizable interface, optional dual pane, and a large array of unique ways to efficiently automate frequently recurring tasks. It's fast and light, it's innovative, and it's portable.
Supported Operating Systems: Windows 10, Server 2014, 8.1, 8, Server 2012, 7, Server 2008, Vista, XP, Server 2003, 2000, NT, Me, 98; 32-bit and 64-bit versions.
XYplorer is a Portable File Manager. It doesn't require any installation or changes to your system or registry. Take it with you and start it from a USB stick, along with your personal configuration. File management to go.
Fonte xyplorer
Existe uma versão freeware.
Aviso de isenção
Eu não sou afiliado com o xyplorer de qualquer forma, eu sou apenas um usuário final do software.