Eu não acredito que haja uma maneira de desabilitar os popups do sistema (além de hacks de registro)
Você pode desbloquear o Drive automaticamente e não haverá um pop-up?
Não é bem a resposta que você provavelmente estava procurando, mas interrompe o pop-up.
Basta clicar em mais opções e, em seguida, marcar a caixa para desbloqueio automático.
Funciona para mim em uma unidade removível, não poderia tentar com um VHD.