Você tentou pressionar ALT + F2 e digitar "unity", depois pressione enter (isso é o mesmo que executar "unity --replace" no shell).
Não o tempo todo, mas intermitentemente, o Unity soltará o menu do HUD. Na maioria das vezes isso é com o GIMP, mas isso aconteceu com outros programas também. As opções de menu estão lá, mas o conteúdo do menu está vazio e o HUD não tem registro dos comandos. Isso pode tornar as coisas simples, como salvar, muito difíceis.
Existe algum comando que eu desconheço para fazer o Unity ir e recarregar os dados do menu de onde ele for e reconstruir as informações do menu.
Minhas especificações são:
Lançamento 12,04 (preciso) 64 bits; Kernel Linux 3.2.0-40 genérico; GNOME 3.4.2; RAM 16GB (reportado como 15.7GB); CHIP: Processador AMD Phenom II X2 555.
Você tentou pressionar ALT + F2 e digitar "unity", depois pressione enter (isso é o mesmo que executar "unity --replace" no shell).