Não está claro, a partir de sua pergunta, se você precisa de cada uma das apresentações para avançar para o próximo slide simultaneamente, a partir de uma sugestão ou se cada uma delas recebe dicas individuais em momentos diferentes.
Se simultaneamente, a solução é bem simples; alguns controles remotos sem fio (alguns modelos Interlink, eu acho?) permitem que você defina várias unidades para ouvir o mesmo "clicker". Isso funcionaria com qualquer sistema, Linux / Windows / Mac / qualquer coisa, que pudesse aceitar cliques de um mouse USB para avançar slides.
Como alternativa, há um aplicativo complementar do Windows PPT chamado PowerShow, acredito, que permite executar e controlar independentemente vários programas PPT de um PC, alimentando vários monitores. O link é o URL, se bem me lembro. Não é uma solução Linux, obviamente, mas pode ajudar.