Não tenho certeza se existe alguma configuração interna no Fedora para isso, mas você pode tentar usar o Windows Transparent
extensão.
Primeiro, remova a extensão que você mencionou para tornar as janelas mais escuras . Depois de instalar a extensão Windows Transparent
.
Allows setting custom opacity globaly and per window basis. You can assign different opacity to active and inactive windows. Also there is a simple mode if all you need are transparent terminals.
Nota: Não funcionará em nada abaixo de 3.10
Boa sorte.