O próprio autologon.exe do programa não pode desabilitar isso. No entanto, tudo que o autologon.exe faz é alterar algumas coisas no registro. Devido a isso, você poderia escrever um script para se livrar dessas configurações do Registro para executar a partir do prompt de comando. Você teria que editar as seções neste conjunto de entradas: NT \ CurrentVersion \ Winlogon HKEY_LOCAL_MACHINE \ SOFTWARE \ Microsoft \ Windows
Eu sei que isso é o oposto do que você está procurando, mas use esta pergunta para obter ajuda: Como faço para alterar o logon automático via script ou linha de comando?