Corra para o mesmo problema hoje - e encontrei a solução em outra página .
Houve uma mudança de kernel, que abriu um bug com o módulo SD. Para corrigi-lo, é necessário alterar algumas opções do módulo do kernel. Primeiro de tudo, teste a configuração executando estes comandos no terminal:
sudo rmmod sdhci_pci sdhci_acpi sdhci
sudo modprobe sdhci debug_quirks2="0x10000"
sudo modprobe sdhci_pci
A primeira linha descarrega o módulo sdhci e os dependentes, a segunda linha está configurando a opção necessária e a terceira linha recarrega os módulos.
Agora teste, se o seu sistema reconhecer cartões SD inseridos. Meu sistema fez instantaneamente.
Se tudo for bem sucedido até agora, temos que empurrar a opção como padrão - para isso, execute este comando como su:
echo "options sdhci debug_quirks2=0x10000" >> /etc/modprobe.d/sdhci.conf
Felicidades =)