A razão aparentemente está no BIOS. Algo mudou o BIOS ... o que causou esse problema. Corrigido por meio de um reflash da imagem mais recente do BIOS no site de suporte da Lenovo no Windows.
Eu notei quando o Windows teve o mesmo problema de interrupções, tendo um monte de CPU, o que aconteceu a partir de ACPI.sys
A única coisa que instalei antes disso foi a atualização do fglrx 11.7 ... IDK se isso tivesse alguma coisa a ver com isso, mas é a única coisa que instalei.