Se você quiser usá-lo mais no futuro, recomendamos configurá-lo em sites diferentes. Como efeito colateral, também reduz a probabilidade de documentos serem colocados no lugar errado (levemente).
Quanto à cópia de lista; é possível usar modelos de lista para listas pequenas (< 10MB), mas obviamente isso não será uma opção para até mesmo um pequeno repositório de documentos.
Eu já fiz isso no passado usando as extensões de stsadm de Gary LaPointe , mas você precisa do acesso administrativo correto para fazê-lo.