De Como instalar a versão de 32 bits do IE9 na versão de 64 bits do Windows 7 :
Actually when you install 64-bit version, 32-bit version will also be installed in your Computer automatically. All you need to do is find the path of IE9 32-bit executable and create a shortcut to it and start using it.
Então, você realmente não tem escolha - ambos estão instalados, exceto que o menu Iniciar apontará para a versão de 64 bits.
E isso também é interessante:
32bit IE9 contains JIT (Just In Time) compiler which converts script into machine code before running it. 64-bit IE9 doesn’t contains JIT compiler that’s why 32bit version runs 4 times faster than 64-bit IE.