Estou ciente das opções de criptografia do disco rígido, como TrueCrypt e outras soluções personalizadas, mas estou curioso para saber se a segurança do Windows fornece qualquer tipo de proteção para uma unidade que é removida ou roubada de um PC. Se eu conceder acesso de leitura a um diretório apenas a membros de um grupo, qualquer usuário poderá acessar esse diretório depois que a unidade for movida para outro PC? Que tal acessar a unidade de uma caixa Mac ou Linux?
As permissões sozinhas não podem proteger uma unidade roubada. Linux e Mac não honram as permissões NTFS e você poderá fazer o que quiser ( desde que tenha o driver ntfs-3g ) . No entanto, se você usar a criptografia NTFS ou o novo Bitlocker (Vista Ultimate +), ficará melhor.
Sistema de arquivos criptografados do Windows (veja a tag efs aqui) irá bloquear seus dados muito bem.
Mas, como John aponta, as permissões não são a resposta.
As permissões e o controle de acesso relacionado só impedirão que usuários definidos pelo administrador do Windows acessem suas propriedades (também dentro dos limites de estabilidade e vulnerabilidade do sistema).
O TrueCrypt e o EFS protegerão seus dados dentro dos limites da tecnologia de criptografia de maneira semelhante. Ele precisaria de alguém para saber sua senha (por qualquer meio) para alcançar seus dados.
Mas, tendo dito isso, eu preferiria usar o TrueCrypt sobre o EFS.