O agendador de tarefas do Windows executará o que você programá-lo para ser executado quando você agendá-lo para ser executado. Parece que você está apenas imaginando:
Se o Windows estiver executando algo enquanto você estiver ausente
ao invés de:
Windows está executando algo enquanto você está ausente
Ou, pelo menos, é assim que eu leio sua pergunta, para responder à minha interpretação, não acredito que exista algo que o Windows esteja fazendo; obviamente, o computador entrará em algum estado de "sono" ou "Processo Ocioso do Sistema", se você estiver apenas sentado e girando os polegares.
Minha teoria sobre o retorno ao atraso do serviço ativo (que a maioria de nós provavelmente encontrará) é que o Windows tem que descobrir de onde parou, especialmente se você deixou os programas rodando e se eles são programas "pesados", pois tem que verifique todos os dados de RAM e os HD's lidos do exe descubra as configurações gráficas à medida que elas mudam do protetor de tela para a interface do usuário; você provavelmente está digitando sua senha para o login do usuário, então tem que verificar tudo isso,
A lista continua, dizendo simplesmente que, apesar de tudo parecer simples (especialmente para um computador que tem elétrons fluindo à velocidade da luz), ainda assim leva tempo; Além disso, à medida que o sistema fica inativo, ele acumula calor e diminui o sistema, e assim por diante.
Bem, esses são meus dois centavos de valor, nenhum conhecimento oficial por trás disso é apenas uma teoria.